如果桉樹種子在水中浸泡的時間過長，可能會導致種子腐爛或失去生長能力，從而影響發芽和幼苗的存活率。

桉樹種子通常具有硬種皮，為了增加發芽率，可以對種子進行處理，一種方法是使用溫水浸泡。浸泡時間應該控制在適當的范圍內，通常在24小時左右。

如果將桉樹種子過度浸泡，可能會導致以下問題：

1. 腐爛：過長時間的浸泡會使種子變軟，增加其受到細菌和真菌感染的風險，進而導致腐爛。

2. 失去生長能力：過度浸泡可能會破壞種子的結構和胚芽，導致失去生長能力，從而無法正常發芽。

建議在溫水中浸泡桉樹種子時，控制浸泡時間在合適的范圍內，不要超過24小時。注意保持水質清潔，以減少細菌和真菌的感染風險。如果種子已經過度浸泡，最好重新獲取新鮮的種子，并采用適宜的浸泡時間進行處理。